Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA3P25788 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA3P25788 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA3P25788 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PSMA3P25788 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA3P25788 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms