Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDELR1P24390 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms