Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCB4P21439 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB4P21439 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms