Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFKB1P19838 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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