Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGB6P18564 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGB6P18564 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGB6P18564 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGB6P18564 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms