Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYCNP04198 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MYCNP04198 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYCNP04198 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYCNP04198 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYCNP04198 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MYCNP04198 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYCNP04198 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYCNP04198 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCNP04198 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCNP04198 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCNP04198 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCNP04198 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCNP04198 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCNP04198 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCNP04198 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCNP04198 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCNP04198 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYCNP04198 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCNP04198 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCNP04198 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCNP04198 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCNP04198 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCNP04198 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCNP04198 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCNP04198 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCNP04198 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYCNP04198 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYCNP04198 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYCNP04198 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MYCNP04198 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MYCNP04198 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYCNP04198 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYCNP04198 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYCNP04198 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYCNP04198 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MYCNP04198 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYCNP04198 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYCNP04198 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MYCNP04198 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms