Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P00740 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F9P00740 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F9P00740 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F9P00740 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F9P00740 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F9P00740 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms