Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAMP4O75379 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VAMP4O75379 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VAMP4O75379 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms