Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PrxO55103 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrxO55103 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrxO55103 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrxO55103 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrxO55103 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrxO55103 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrxO55103 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrxO55103 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrxO55103 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrxO55103 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrxO55103 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrxO55103 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrxO55103 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrxO55103 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrxO55103 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrxO55103 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrxO55103 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrxO55103 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrxO55103 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrxO55103 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrxO55103 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrxO55103 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrxO55103 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PrxO55103 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrxO55103 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrxO55103 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrxO55103 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrxO55103 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrxO55103 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrxO55103 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrxO55103 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrxO55103 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrxO55103 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrxO55103 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrxO55103 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrxO55103 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrxO55103 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrxO55103 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrxO55103 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PrxO55103 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrxO55103 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrxO55103 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrxO55103 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrxO55103 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrxO55103 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrxO55103 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrxO55103 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PrxO55103 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrxO55103 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrxO55103 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrxO55103 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrxO55103 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrxO55103 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrxO55103 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PrxO55103 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrxO55103 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrxO55103 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrxO55103 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrxO55103 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrxO55103 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrxO55103 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrxO55103 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PrxO55103 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PrxO55103 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrxO55103 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrxO55103 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrxO55103 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrxO55103 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrxO55103 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms