Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYNGR3O43761 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SYNGR3O43761 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms