Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
J3KR12 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
J3KR12 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
J3KR12 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
J3KR12 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
J3KR12 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
J3KR12 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
J3KR12 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
J3KR12 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
J3KR12 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms