Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Farp1F8VPU2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Farp1F8VPU2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.1 ms