Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700015F17RikD3YUK8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms