Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd8B9EJ80 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms