Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP27XA6NNY8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP27XA6NNY8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms