Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SERINC4A6NH21 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SERINC4A6NH21 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms