Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms