Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AUP1Q9Y679 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms