Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRRAPQ9Y4A5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRRAPQ9Y4A5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms