Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP3Q9Y228 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP3Q9Y228 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms