Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM10Q9UDY6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM10Q9UDY6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms