Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX43Q9NXZ2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX43Q9NXZ2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms