Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPRD1BQ9NQG5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRD1BQ9NQG5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRD1BQ9NQG5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRD1BQ9NQG5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRD1BQ9NQG5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRD1BQ9NQG5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRD1BQ9NQG5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRD1BQ9NQG5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRD1BQ9NQG5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRD1BQ9NQG5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPRD1BQ9NQG5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms