Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pole3Q9JKP7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms