Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sv2aQ9JIS5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sv2aQ9JIS5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms