Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESP1

Sdf2l1, Stromal cell-derived factor 2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2l1Q9ESP1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2l1Q9ESP1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2l1Q9ESP1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2l1Q9ESP1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2l1Q9ESP1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2l1Q9ESP1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2l1Q9ESP1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2l1Q9ESP1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2l1Q9ESP1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdf2l1Q9ESP1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdf2l1Q9ESP1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms