Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Wdr53Q9DB94 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr53Q9DB94 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms