Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smurf1Q9CUN6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms