Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt84Q99M73 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt84Q99M73 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt84Q99M73 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms