Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TM4SF18Q96CE8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TM4SF18Q96CE8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms