Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC10Q969S8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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HDAC10Q969S8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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HDAC10Q969S8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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HDAC10Q969S8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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HDAC10Q969S8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC10Q969S8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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