Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAVIN3Q969G5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN3Q969G5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms