Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b5Q923D4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b5Q923D4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms