Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Basp1Q91XV3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Basp1Q91XV3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms