Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
TRIM41Q8WV44 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
TRIM41Q8WV44 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRIM41Q8WV44 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms