Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d2Q8VD57 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d2Q8VD57 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms