Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc12Q8R344 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms