Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RDH13Q8NBN7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH13Q8NBN7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms