Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TtpaQ8BWP5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms