Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gabra5Q8BHJ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms