Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF13Q86YI8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF13Q86YI8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms