Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPM2Q86SE8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NPM2Q86SE8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms