Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT25Q7Z3Z0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT25Q7Z3Z0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms