Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI0

Znf12, Zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf12Q7TSI0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf12Q7TSI0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znf12Q7TSI0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf12Q7TSI0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms