Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2r2Q6ZWZ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms