Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Gja6Q6S5G4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms