Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM220Q6QAJ8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM220Q6QAJ8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms