Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VIRMAQ69YN4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VIRMAQ69YN4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
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