Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9a1Q61165 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc9a1Q61165 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms