Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR44Q5JSH3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms